Akçakır O. (Yürütücü), Gücin Z., Çoban G.
Vakıf, 2021 - 2022
|
Karaciğer fibrozisinin evrelendirilmesinde doku kesitleri, çeşitli histokimyasal boyalar kullanılarak görüntülenmekte
ve patolog tarafından incelenmektedir. Fakat, hastalığın evresinin
belirlenmesinde patologlar arasında belirgin fark olmaktadır. Bu durum kısmen
laboratuvarlar arasındaki boyama prosedüründeki farklılıklar, kısmen de
evrelendirme prosedürünün yarı nicel olmasından kaynaklanmaktadır.
Projemizde, bu sorunları dijital patoloji için boyama olmaksızın kantitatif
faz görüntülenmesi ile çözmeyi hedefliyoruz.
Kantitatif faz görüntüleme tekniği, doku dilimindeki kütle yoğunluk
dağılımını haritalandırır. Bu yoğunluk dağılımı henüz karaciğer fibrozisinde incelenmemiştir. Bu projede kantitatif faz görüntü bilgisiyle
karaciğer fibrozisini evrelemeyi planlıyoruz.
Ayrıca, doğru ve objektif fibrozis evrelendirilmesi için makine
öğrenme eğitim prosedürü boyunca üretilen özniteliklere dayanan yaklaşımı
kullanacağız. Bugüne kadar kantitatif
faz ile karaciğer fibrozisinin evrelendirilmesi yapılmamıştır. Bu proje,
bahsedilen bu alanda bir ilk olma niteliğindedir. Karaciğer fibrozisinin objektif bilgisayar
tabanlı teknikleri kullanarak evrelendirilmesi de diğer bir katkıdır. Makine
öğrenme teknikleri, gösterdiği üstün performans sayesinde bilgisayar tabanlı
görüntüleme uygulamalarında yaygın olarak kullanılmaktadır ve bu tekniğin
insan karaciğer biyopsilerinde karaciğer fibrozis evrelendirilmesinde
doğruluğu, hassasiyeti ve spesifikliği iyileştireceğine inanmaktayız. Standart
boyama ile elde edilen görüntülere dayanan makine öğrenme tekniklerde yeni
vakalara genelleştirebilmek için kullanılan verinin benzer istatistiksel
özelliğe sahip olması gerekmektedir.
Boyanmış örneklerin kullanıldığı geleneksel görüntüleme yöntemleri bu
konuda büyük değişkenlik göstermektedir.
Kantitatif faz görüntüleme metodunda numunenin içsel özelliklerini
ölçülmekte olup, boyama ile ilgili değişiklik
göstermemektedir. Bu çalışmamızda kantitatif faz görüntülemeyi ve makine öğrenmesini
bir araya getirerek daha doğru ve küresel ölçekte
kullanılabilir bir karaciğer fibrozis evreleme metodu geliştirmeyi
hedefliyoruz. |